Công ty TNHH Y Học Cổ Truyền Đại Hồng Phúc tiền thân là xưởng nghiên cứu sản xuất thuốc Y học cổ truyền trực thuộc Công ty Dược liệu Trung Ương II từ năm 1997. Đến năm 2000, ông Nguyễn Đình Phúc chính thức thành lập Cơ sở sản xuất thuốc Y học cổ truyền Đại Hồng Phúc và sản xuất ổn định đến năm 2016, cơ sở đầu tư xây dựng nhà máy theo tiêu chuẩn “Thực hành tốt sản xuất thuốc” và chuyển đổi thành Công ty TNHH Y học cổ truyền Đại Hồng Phúc, được Bộ Y tế thẩm định nhà máy sản xuất đạt tiêu chuẩn GMP-WHO.
Mới đây, năm 2023, Công ty đã được Cục Quản lý Y - Dược cổ truyền thẩm định và tiếp tục đáp ứng tiêu chuẩn GMP thuốc cổ truyền.